В структурата на Факултета по ветеринарна медицина са обособени три катедри:
Катедра „Биомедицински науки“
Катедра „Предклинични науки“
Катедра „Клинични науки“, включваща следните сектори:
„Заразна патология“
„Незаразна патология“
„Хигиена, технология и контрол на храните от животински произход, общественоветеринарно дело, законодателство и съдебна ветеринарна медицина“

