В структурата на факултета са обособени седем катедри:
- сектор "Хигиена, медицинска екология и професионални заболявания"
- сектор "Медицина на бедствените ситуации"
- сектор "Обща медицина"
- сектор "Съдебна медицина и деонтология"
- Катедра "Психиатрия и медицинска психология"
- Катедра „Социална медицина и здравен мениджмънт“
- Катедра "Управление на здравните грижи, медицинска етика и информационни технологии"
- Катедра "Физикална медицина, рехабилитация, ерготерапия и спорт"
- сектор "Физикална медицина, рехабилитация и ерготерапия"
- сектор "Физическо възпитание и спорт"
- Катедра "Хигиена, медицинска екология, професионални заболявания и медицина на бедствените ситуации"
- сектор "Хигиена, медицинска екология и професионални заболявания"
- сектор "Медицина на бедствените ситуации"